对篮球场还有惦念的乔丹在2001年再次宣布复出，这也是乔老爷著名的三大复出之最后一复。当时复出和华盛顿奇才队签署了为期两年的合同，乔丹在加盟奇才时说过自己会带领奇才队打进季后赛，不过两年的奇才生涯乔丹都未能帮助球队打进季后赛。

2002-2003赛季，乔丹参加了职业生涯最后一次全明星之旅，在全明星赛上，乔丹将自己的衣钵传给了科比、麦迪、艾弗森等人，希望他们能将NBA和篮球精神传承下去，赛季结束后乔丹彻底离开了赛场，作为球员他已经取得了所有荣誉，已经40岁高龄的他不需要再证明什么，是时候彻底离开了。

其实乔丹第三次复出本身就是为了拯救奇才队的球市华盛顿，因为那时候他已经是奇才的小老板了，不过打了两年还是没有能将奇才带进季后赛，飞人也就退役了。他的退役最重要的是厌倦了吧，就像他第一二次一样的。少了兄弟多了利益，不如索性退役，留下美好的东西！

2003年4月16日，迈克尔-乔丹在职业生涯最后一场奇才主场对阵76人比赛的赛后正式宣布退役。作为公认的史上最伟大的篮球运动员，乔丹在2009年9月11日正式入选奈-史密斯篮球名人纪念堂。

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